Родился 25.10.1907 в деревне Воропино ныне Шатурского района Московской области в семье крестьянина. Русский. Член КПСС с 1938. Окончил 3 курса Московского строительно-конструкторского техникума.

В Советской Армии с 1933. В 1935 окончил Энгельсскую военно-авиационную школу пилотов.

На фронте с сентября 1941.

Командир эскадрильи 448-го штурмового авиаполка (281-я шад, 13-я воздушная армия, Ленинградский фронт), старший лейтенант.

К ноябрю 1944 совершил 301 боевой вылет, уничтожил более 60 орудий и минометов, 7 самолетов противника на аэродромах, 26 железно-дорожных вагонов, 14 складов с боеприпасами и горючим.

Звание Героя Советского Союза присвоено 23.02.1945.

С 1946 майор Никишин — в отставке. В 1948 окончил школу высшей летной подготовки ГВФ. Работал пилотом гражданской авиации. С 1954 жил и работал в Москве.

Награжден орденом Ленина, 2 орденами Красного Знамени, орденами Отечественной войны 1 степени, орденом Отечественной войны 2 степени, медалями.

Умер 29.12.1982.