Родился 18.3.1918 в деревне Клин ныне Починковского района Смоленской области в семье крестьянина. Русский. Член КПСС с 1944. Окончил 7 классов и школу ФЗУ. Работал шлифовальщиком на заводе«Автостекло» в городе Константиновка Донецкой области.

В Советской Армии с 1939. Окончил школу младших авиационных специалистов.

На фронте с августа 1941. В 1943 прошел летную подготовку в учебном центре, в 1944 окончил курсы заместителей командиров эскадрилий.

Заместитель командира эскадрильи 198-го штурмового авиаполка (233-я шад, 4-я воздушная армия, 2-й Белорусский фронт), лейтенант.

К октябрю 1944 совершил 104 боевых вылета на штурмовку войск противника.

Звание Героя Советского Союза присвоено 23.02.45.

В 1945 окончил Высшие офицерские летно-тактические курсы. С 1956 капитан Якуненко — в запасе. Живет в городе Жуковский Московской области. Работал механиком на домостроительном комбинате.

Награжден орденами Ленина, Красного Знамени, Отечественной войны 1 и 2 степени, Красной Звезды, медалями.